Tmavší zbarvení získá naše moč při nedostatku tekutin, neboť je pak moč koncentrovanější. To je typické i pro první ranní moč. Tmavší barvu moči mohou způsobit i potraviny nebo léky, například sníte-li červenou šanci, máte zhruba 15% šanci, že se vaše moč zabarví.
V některých případech signalizuje tmavá či hnědá moč signalizuje onemocnění jater (infekční žloutenka) či nemožnost odtoku žluči (například kvůli žlučovým kamenům).
Je-li v moči přítomna krev, poznáme také podle zbarvení, v tomto případě by měla moč červenou až hnědou barvu v závislosti na tom, odkud krev pochází. Při vyplavování hemoglobinu do moči kvůli rozpadu červených krvinek má moč také jinou barvu, stejně je tomu i v případě vyplavování svalového barviva myoglobin, ke kterému dochází při poškození svalů.
Ve většině případů provází zbarvenou moč i řada dalších příznaků. Někdy může být na vině i vzácná vrozená metabolická choroba, při porfyriích má moč tmavě červené zbarvení, při alkaptonurii moč změní barvu na tmavší až v reakci se vzduchem.